Ghost Stories ne spune povestea lui Satsuki Miyanoshita, care, după ce mama ei a murit, se mută cu restul familiei în orașul în care s-a născut mama sa. În prima zi de școală, Satsuki Keiichirou (fratele ei mai mic - clasa I-a) Hajime Aoyama (vecinul lor), Momoko Koigakubo (o colegă din școală, mai mare ca vârstă) și Leo Kakinoki (coleg și prieten cu Hajime, și care are înclinații spre paranormal) vizitează școala veche, acum abandonată, și descoperă că acea clădire este bântuită. La scurt timp după ce descoperă că mama ei a fost cea care a sigilat fantomele care bântuiau nu numai clădirea școlii vechi, dar și restul orașului, Satsuki se vede nevoită să lupte și ea cu acele fantome care au fost eliberate din cauza urbanizării zonei din apropierea orașului. Mama lui Satsuki a lăsat în urma sa un jurnal în care detaliază modul în care pot fi exorcizate fantomele.

Van, un spadasin slab și apatic, se află într-o călătorie pentru a-l ucide pe ucigașul logodnicului său. Singura caracteristică pe care trebuie să o îndeplinească este că ucigașul are o gheară pentru un braț, de aceea criminalul fiind denumit Omul cu gheare. În timpul călătoriilor sale, Van se întâmplă să treacă prin orașul Evergreen, care se apără de bandiții care urmăresc să jefuiască orașul de vistieria. În acest oraș, Van o întâlnește pe Wendy Garret, o tânără timidă care își caută fratele răpit. Când orașul pledează pentru ajutorul lui Van pentru a-l apăra, el refuză, pretinzând că nu are nimic de-a face cu el și, astfel, lasă orașul pe cont propriu să facă față pericolului. La scurt timp după, Van întâlnește el însuși bandiții care fac raiduri și, în cele din urmă, aceștia îl bifează pe spadasin într-o măsură în care acesta ia măsuri împotriva lor pentru propria sa răzbunare personală.

Un licean capătă puterea de a face pe oricine să i se supună. Ascuns după o mască, acesta va conduce revolta Japoniei contra invadatorilor din Britannia.